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Nature:重大突破 破解蛋白結(jié)構的SAS新技術

2016-11-072441點擊

 

來源:生物360
 

 
        近日,美國勞倫斯伯克利國家實驗室(Lawrence Berkeley National Laboratory)與斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)的研究人員發(fā)表了一項飛躍性的成果,使得人們更夠深入地了解蛋白質(zhì)之類的大分子在溶液中的結(jié)構狀態(tài)。研究人員利用X射線(SAXS) 或中子(SANS)SAS小角散射實驗數(shù)據(jù),開發(fā)出了一套新指標,這將能令所需時間縮減達20倍。SAS指標將會對調(diào)控細胞生物學可變分子機器的分析,以 及精確高通量解析,產(chǎn)生極大的影響。相關研究論文刊登在了近期出版的《自然》(Nature)雜志上。
 
        研究人員表示,SAS(small- angle scattering)是唯一一種能在單個圖像中反映大分子完整熱力學狀態(tài)的技術。在之前的研究中,SAS分析主要集中在離散結(jié)構狀態(tài)中的顆粒,但是,對 于生物學而言,許多蛋白質(zhì)和蛋白復合物并不都能“乖乖地聽話”,它們可能非常多變,導致了彌漫型的結(jié)構狀態(tài)。新研究中的這一套新衡量標準適用于所有粒子類型。
 
        SAS成像利用X射線或中子穿透樣品,在X射線或中子,和樣品納米或亞納米大小顆粒之間產(chǎn)生微小碰撞,然后檢測這些碰撞散射的方式,從而確定出顆粒的形狀和大小。這種方法比X-射線晶體學方法更容易應用于大分子復合物,對于具有高柔性的蛋白質(zhì)和復合物尤為有用。
 
        在這項最新研究中,科學家們創(chuàng)建的分析標準則是通過一個不變的SAS制定,也就是說其值不會隨著測量方法和測量地點而改變,這種不變量被稱為“體積的相關 性”(volume-of-correlation),它的值是來自于X射線或中字的散射強度,對應于粒子的結(jié)構狀態(tài),并且這與其濃度和復合物無關。
 
        這種相關性能用于改變了形狀的蛋白,并利用這些數(shù)據(jù)集幫助傳統(tǒng)的SAS分析結(jié)果更加可靠,從而對這種從溶液中獲取的結(jié)構的準確性進行確認。這種優(yōu)化增強了SAS用于高通量分析工作的內(nèi)在能力,應能擴大其對于研究溶液中的柔性大分子和納米顆粒的應用。
 
        研究人員表示,根據(jù)這種衡量標準,可能可以從理論極限收集并分析SAS數(shù)據(jù),這意味著科學家可以減少數(shù)據(jù)收集的時間,儀器所需的90分鐘時間可以縮短到9分鐘。這一發(fā)現(xiàn)是首個X射線散射不變量成果,并且體積相關性不變量這一新發(fā)現(xiàn)也打開了未來可變生物學樣品分析的一扇窗。
 
原文檢索:
Robert P. Rambo& John A. Tainer. Accurate assessment of mass, models and resolution by small-angle scattering. Nature, 24 April 2013; doi:10.1038/nature12070
 

 

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